В процессе инсталяции клиентского программного обеспечения участнику системы присваивается уникальный 12-значный идентификатор, необходимый для запуска программы и работы в системе.
Далее пользователь самостоятельно назначает пароль и определяет место в памяти компьютера для хранения файлов с секретным ключом и кошельками. Таким образом, для последующего входа в систему необходимо указывать WM-идентификатор, личный пароль и расположение в памяти файлов с ключом и кошельками.
После установки WM Keeper автоматически создает один Z-кошелек. Остальные кошельки создаются участником самостоятельно по мере необходимости. Номер кошелька, используемого для совершения сделки, участник сообщает партнеру. При этом партнер может только отправлять WebMoney на указанный кошелек и не имеет возможности снимать их с кошелька другого участника.